Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAM27E3Q08E93 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms