Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms