Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms