Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms