Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms