Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms