Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms