Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms