Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RPS29P62273 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms