Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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