Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCCD1P59942 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms