Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LOXL3P58215 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms