Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms