Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRG3P56975 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms