Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2A1P52655 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms