Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB28P51157 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB28P51157 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms