Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT5P48643 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT5P48643 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms