Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ETV4P43268 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV4P43268 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms