Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP7BP35670 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7BP35670 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms