Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA9P31269 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms