Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E1P29083 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms