Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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