Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms