Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POP4O95707 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POP4O95707 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POP4O95707 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POP4O95707 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms