Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms