Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NDUFS4O43181 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NDUFS4O43181 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NDUFS4O43181 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NDUFS4O43181 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NDUFS4O43181 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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