Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRTO14522 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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