Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms