Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms