Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DXG7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DXG7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DXG7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DXG7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DXG7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DXG7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms