Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms