Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM223A0PJW6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms