Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
HECTD4Q9Y4D8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms