Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG3Q9Y2Y8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRG3Q9Y2Y8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms