Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms