Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms