Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NKX1-2Q9UD57 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms