Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms