Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms