Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30AQ9NV96 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms