Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PFDN4Q9NQP4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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