Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C20orf27Q9GZN8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms