Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms