Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms