Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms