Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTKNQ9BST9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms