Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms