Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms