Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms