Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNDC1Q96C34 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms